Da Endometriose so eine komplexe Erkrankung ist, die den ganzen Körper betrifft, ist es besonders wichtig, Expertinnen und Experten dafür aufzusuchen. Solche sind in zertifizierten Endometriosepraxen, Endometriosekliniken oder Endometriosezentren zu finden. Laut der Endometriose Vereinigung Deutschland e.V. bedeutet „zertifiziert“, dass diese Einrichtungen regelmäßig durch die EuroEndoCert (EEC) in ihrer Arbeit überprüft werden und ein spezielles Zertifikat erhalten haben. Die Einrichtungen arbeiten interdisziplinär und die Patientinnen und Patienten erhalten eine Behandlung nach der Leitlinie zur Diagnostik und Therapie der Endometriose.
Im Schleswig-Holstein gibt es zwei zertifizierte Endometriosezentren, eins am UKSH Kiel und eins am UKSH Lübeck sowie zwei zertifizierte Reha-Kliniken (Ratzeburg und Bad Schwartau). Alle weiteren spezialisierten Einrichtungen können auf der Website der Endometriose Vereinigung angesehen werden.